Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpne9Q1RLL3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne9Q1RLL3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne9Q1RLL3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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