Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spatc1Q148B6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Spatc1Q148B6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Spatc1Q148B6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spatc1Q148B6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms