Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cnn2Q08093 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnn2Q08093 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnn2Q08093 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms