Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou6f1Q07916 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou6f1Q07916 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pou6f1Q07916 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms