Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atf4Q06507 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atf4Q06507 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Atf4Q06507 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms