Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcn1Q05186 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rcn1Q05186 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rcn1Q05186 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms