Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox8Q04886 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox8Q04886 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox8Q04886 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox8Q04886 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox8Q04886 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox8Q04886 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox8Q04886 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox8Q04886 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox8Q04886 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms