Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RelaQ04207 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RelaQ04207 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RelaQ04207 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelaQ04207 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelaQ04207 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RelaQ04207 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RelaQ04207 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RelaQ04207 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RelaQ04207 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RelaQ04207 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RelaQ04207 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RelaQ04207 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms