Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcqQ02111 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcqQ02111 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcqQ02111 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcqQ02111 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcqQ02111 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcqQ02111 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcqQ02111 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcqQ02111 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcqQ02111 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcqQ02111 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcqQ02111 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkcqQ02111 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkcqQ02111 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms