Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1cQ01815 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1cQ01815 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1cQ01815 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms