Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrcdQ00LT2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrcdQ00LT2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms