Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GabpaQ00422 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GabpaQ00422 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GabpaQ00422 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GabpaQ00422 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms