Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhodP97348 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhodP97348 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhodP97348 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RhodP97348 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhodP97348 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhodP97348 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhodP97348 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhodP97348 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhodP97348 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhodP97348 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhodP97348 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhodP97348 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhodP97348 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhodP97348 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhodP97348 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhodP97348 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhodP97348 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhodP97348 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RhodP97348 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhodP97348 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhodP97348 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhodP97348 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhodP97348 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhodP97348 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhodP97348 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhodP97348 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhodP97348 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhodP97348 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhodP97348 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhodP97348 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhodP97348 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RhodP97348 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RhodP97348 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RhodP97348 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RhodP97348 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RhodP97348 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RhodP97348 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RhodP97348 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RhodP97348 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RhodP97348 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RhodP97348 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RhodP97348 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RhodP97348 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RhodP97348 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RhodP97348 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RhodP97348 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RhodP97348 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RhodP97348 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RhodP97348 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RhodP97348 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RhodP97348 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RhodP97348 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RhodP97348 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RhodP97348 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RhodP97348 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RhodP97348 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RhodP97348 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RhodP97348 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RhodP97348 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RhodP97348 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RhodP97348 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RhodP97348 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RhodP97348 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RhodP97348 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RhodP97348 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RhodP97348 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RhodP97348 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RhodP97348 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RhodP97348 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RhodP97348 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RhodP97348 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RhodP97348 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RhodP97348 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RhodP97348 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RhodP97348 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RhodP97348 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RhodP97348 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RhodP97348 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RhodP97348 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhodP97348 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhodP97348 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhodP97348 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhodP97348 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhodP97348 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhodP97348 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhodP97348 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhodP97348 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhodP97348 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhodP97348 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhodP97348 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhodP97348 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhodP97348 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhodP97348 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RhodP97348 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhodP97348 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhodP97348 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhodP97348 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhodP97348 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhodP97348 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms