Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mesp1P97309 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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