Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgcgP82348 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgcgP82348 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgcgP82348 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgcgP82348 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgcgP82348 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgcgP82348 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgcgP82348 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SgcgP82348 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgcgP82348 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcgP82348 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgcgP82348 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgcgP82348 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SgcgP82348 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms