Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb1P70662 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb1P70662 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb1P70662 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms