Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erbb2P70424 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Erbb2P70424 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Erbb2P70424 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Erbb2P70424 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms