Protein–RNA interactions for Protein: P63280

Ube2i, SUMO-conjugating enzyme UBC9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2iP63280 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2iP63280 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube2iP63280 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2iP63280 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube2iP63280 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube2iP63280 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube2iP63280 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2iP63280 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2iP63280 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2iP63280 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2iP63280 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2iP63280 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2iP63280 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube2iP63280 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2iP63280 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2iP63280 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2iP63280 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2iP63280 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2iP63280 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2iP63280 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2iP63280 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2iP63280 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2iP63280 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms