Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crip1P63254 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crip1P63254 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crip1P63254 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crip1P63254 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crip1P63254 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crip1P63254 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Crip1P63254 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crip1P63254 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crip1P63254 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crip1P63254 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crip1P63254 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crip1P63254 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crip1P63254 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms