Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm5P62322 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm5P62322 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms