Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps13P62301 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps13P62301 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps13P62301 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps13P62301 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rps13P62301 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps13P62301 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps13P62301 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps13P62301 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps13P62301 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps13P62301 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps13P62301 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps13P62301 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps13P62301 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps13P62301 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps13P62301 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps13P62301 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps13P62301 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps13P62301 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps13P62301 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps13P62301 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps13P62301 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps13P62301 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps13P62301 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps13P62301 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps13P62301 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps13P62301 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps13P62301 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps13P62301 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps13P62301 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps13P62301 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps13P62301 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps13P62301 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps13P62301 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps13P62301 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps13P62301 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms