Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo4P61969 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo4P61969 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms