Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Actr1aP61164 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Actr1aP61164 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actr1aP61164 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms