Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snap25P60879 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap25P60879 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snap25P60879 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap25P60879 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snap25P60879 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap25P60879 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap25P60879 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap25P60879 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap25P60879 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Snap25P60879 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap25P60879 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snap25P60879 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap25P60879 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms