Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps5P59438 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps5P59438 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hps5P59438 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hps5P59438 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hps5P59438 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hps5P59438 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hps5P59438 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps5P59438 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps5P59438 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hps5P59438 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hps5P59438 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hps5P59438 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hps5P59438 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms