Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ripk2P58801 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk2P58801 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk2P58801 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk2P58801 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms