Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm6sf1P58749 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm6sf1P58749 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tm6sf1P58749 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tm6sf1P58749 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms