Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PmchP56942 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PmchP56942 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PmchP56942 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PmchP56942 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PmchP56942 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PmchP56942 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PmchP56942 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PmchP56942 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PmchP56942 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PmchP56942 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PmchP56942 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PmchP56942 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PmchP56942 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PmchP56942 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PmchP56942 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PmchP56942 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PmchP56942 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PmchP56942 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PmchP56942 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PmchP56942 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PmchP56942 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PmchP56942 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PmchP56942 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PmchP56942 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PmchP56942 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PmchP56942 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PmchP56942 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PmchP56942 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PmchP56942 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PmchP56942 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PmchP56942 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PmchP56942 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PmchP56942 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PmchP56942 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PmchP56942 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PmchP56942 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PmchP56942 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PmchP56942 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PmchP56942 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmchP56942 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmchP56942 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmchP56942 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmchP56942 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmchP56942 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmchP56942 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmchP56942 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmchP56942 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmchP56942 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmchP56942 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmchP56942 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmchP56942 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmchP56942 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmchP56942 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmchP56942 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmchP56942 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmchP56942 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PmchP56942 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmchP56942 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmchP56942 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmchP56942 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmchP56942 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmchP56942 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmchP56942 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmchP56942 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmchP56942 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PmchP56942 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmchP56942 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmchP56942 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmchP56942 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmchP56942 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmchP56942 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms