Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gsc2P56916 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms