Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GferP56213 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GferP56213 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GferP56213 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GferP56213 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GferP56213 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GferP56213 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GferP56213 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GferP56213 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GferP56213 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GferP56213 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GferP56213 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GferP56213 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GferP56213 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GferP56213 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GferP56213 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GferP56213 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GferP56213 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GferP56213 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GferP56213 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GferP56213 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GferP56213 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GferP56213 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GferP56213 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GferP56213 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GferP56213 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GferP56213 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GferP56213 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GferP56213 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GferP56213 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GferP56213 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GferP56213 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GferP56213 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GferP56213 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GferP56213 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GferP56213 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GferP56213 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GferP56213 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GferP56213 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GferP56213 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GferP56213 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GferP56213 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GferP56213 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GferP56213 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GferP56213 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GferP56213 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GferP56213 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GferP56213 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GferP56213 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GferP56213 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GferP56213 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GferP56213 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GferP56213 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GferP56213 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GferP56213 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GferP56213 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GferP56213 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GferP56213 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GferP56213 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GferP56213 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GferP56213 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GferP56213 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GferP56213 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GferP56213 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GferP56213 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GferP56213 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GferP56213 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GferP56213 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GferP56213 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GferP56213 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GferP56213 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GferP56213 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GferP56213 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GferP56213 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GferP56213 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GferP56213 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GferP56213 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GferP56213 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GferP56213 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GferP56213 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GferP56213 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GferP56213 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GferP56213 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GferP56213 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GferP56213 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GferP56213 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GferP56213 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GferP56213 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GferP56213 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GferP56213 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GferP56213 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms