Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CebpaP53566 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CebpaP53566 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CebpaP53566 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CebpaP53566 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CebpaP53566 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CebpaP53566 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CebpaP53566 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CebpaP53566 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CebpaP53566 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CebpaP53566 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CebpaP53566 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CebpaP53566 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms