Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ube2e1P52482 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2e1P52482 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms