Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnni3P48787 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni3P48787 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni3P48787 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms