Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prox1P48437 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prox1P48437 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prox1P48437 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prox1P48437 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prox1P48437 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prox1P48437 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prox1P48437 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Prox1P48437 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prox1P48437 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prox1P48437 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prox1P48437 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prox1P48437 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prox1P48437 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prox1P48437 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prox1P48437 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prox1P48437 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prox1P48437 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prox1P48437 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prox1P48437 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prox1P48437 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prox1P48437 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prox1P48437 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prox1P48437 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prox1P48437 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prox1P48437 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prox1P48437 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prox1P48437 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Prox1P48437 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prox1P48437 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prox1P48437 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prox1P48437 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms