Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VdrP48281 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VdrP48281 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VdrP48281 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VdrP48281 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VdrP48281 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VdrP48281 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VdrP48281 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VdrP48281 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VdrP48281 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VdrP48281 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VdrP48281 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VdrP48281 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VdrP48281 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VdrP48281 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VdrP48281 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VdrP48281 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VdrP48281 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VdrP48281 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VdrP48281 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VdrP48281 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VdrP48281 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VdrP48281 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VdrP48281 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VdrP48281 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VdrP48281 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VdrP48281 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VdrP48281 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VdrP48281 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VdrP48281 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VdrP48281 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VdrP48281 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VdrP48281 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VdrP48281 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VdrP48281 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VdrP48281 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VdrP48281 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VdrP48281 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VdrP48281 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VdrP48281 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VdrP48281 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VdrP48281 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VdrP48281 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VdrP48281 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VdrP48281 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VdrP48281 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VdrP48281 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VdrP48281 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VdrP48281 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VdrP48281 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VdrP48281 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VdrP48281 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VdrP48281 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VdrP48281 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VdrP48281 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VdrP48281 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VdrP48281 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VdrP48281 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VdrP48281 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VdrP48281 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VdrP48281 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VdrP48281 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VdrP48281 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VdrP48281 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VdrP48281 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VdrP48281 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VdrP48281 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VdrP48281 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VdrP48281 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VdrP48281 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VdrP48281 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VdrP48281 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VdrP48281 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VdrP48281 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VdrP48281 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VdrP48281 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VdrP48281 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VdrP48281 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VdrP48281 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VdrP48281 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VdrP48281 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VdrP48281 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VdrP48281 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VdrP48281 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VdrP48281 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VdrP48281 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VdrP48281 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VdrP48281 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VdrP48281 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VdrP48281 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VdrP48281 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms