Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb41P48193 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epb41P48193 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epb41P48193 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epb41P48193 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epb41P48193 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb41P48193 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb41P48193 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb41P48193 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Epb41P48193 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb41P48193 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb41P48193 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb41P48193 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb41P48193 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epb41P48193 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb41P48193 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb41P48193 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb41P48193 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb41P48193 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb41P48193 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb41P48193 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms