Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sept1P42209 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sept1P42209 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sept1P42209 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sept1P42209 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sept1P42209 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sept1P42209 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept1P42209 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sept1P42209 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sept1P42209 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sept1P42209 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sept1P42209 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sept1P42209 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sept1P42209 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sept1P42209 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sept1P42209 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sept1P42209 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms