Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv1P41164 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv1P41164 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv1P41164 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv1P41164 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Etv1P41164 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Etv1P41164 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Etv1P41164 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv1P41164 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Etv1P41164 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv1P41164 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv1P41164 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv1P41164 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv1P41164 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv1P41164 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Etv1P41164 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Etv1P41164 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms