Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfc1P35601 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfc1P35601 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc1P35601 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc1P35601 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms