Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pola2P33611 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pola2P33611 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola2P33611 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola2P33611 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola2P33611 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola2P33611 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola2P33611 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola2P33611 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola2P33611 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola2P33611 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola2P33611 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola2P33611 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pola2P33611 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pola2P33611 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pola2P33611 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola2P33611 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola2P33611 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola2P33611 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola2P33611 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola2P33611 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms