Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdgfbP31240 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfbP31240 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfbP31240 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfbP31240 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms