Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sstr1P30873 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sstr1P30873 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sstr1P30873 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sstr1P30873 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms