Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cnga1P29974 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cnga1P29974 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms