Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epha3P29319 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epha3P29319 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Epha3P29319 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Epha3P29319 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Epha3P29319 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Epha3P29319 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha3P29319 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha3P29319 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Epha3P29319 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Epha3P29319 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha3P29319 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha3P29319 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha3P29319 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epha3P29319 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epha3P29319 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha3P29319 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms