Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprmP28828 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprmP28828 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprmP28828 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprmP28828 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprmP28828 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprmP28828 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprmP28828 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprmP28828 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprmP28828 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtprmP28828 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtprmP28828 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprmP28828 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprmP28828 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprmP28828 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprmP28828 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprmP28828 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprmP28828 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprmP28828 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprmP28828 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprmP28828 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprmP28828 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprmP28828 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprmP28828 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprmP28828 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprmP28828 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PtprmP28828 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprmP28828 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprmP28828 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprmP28828 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
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