Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LoxP28301 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LoxP28301 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LoxP28301 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LoxP28301 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LoxP28301 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LoxP28301 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LoxP28301 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LoxP28301 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LoxP28301 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LoxP28301 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LoxP28301 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LoxP28301 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LoxP28301 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LoxP28301 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LoxP28301 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LoxP28301 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LoxP28301 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LoxP28301 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LoxP28301 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LoxP28301 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LoxP28301 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LoxP28301 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LoxP28301 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LoxP28301 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LoxP28301 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LoxP28301 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LoxP28301 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LoxP28301 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LoxP28301 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LoxP28301 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LoxP28301 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LoxP28301 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LoxP28301 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LoxP28301 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LoxP28301 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LoxP28301 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LoxP28301 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LoxP28301 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LoxP28301 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LoxP28301 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LoxP28301 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LoxP28301 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LoxP28301 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LoxP28301 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LoxP28301 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LoxP28301 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LoxP28301 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LoxP28301 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LoxP28301 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LoxP28301 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LoxP28301 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LoxP28301 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LoxP28301 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LoxP28301 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LoxP28301 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LoxP28301 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LoxP28301 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LoxP28301 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LoxP28301 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LoxP28301 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LoxP28301 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LoxP28301 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LoxP28301 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LoxP28301 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LoxP28301 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LoxP28301 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LoxP28301 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LoxP28301 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LoxP28301 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LoxP28301 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LoxP28301 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LoxP28301 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LoxP28301 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LoxP28301 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LoxP28301 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LoxP28301 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LoxP28301 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LoxP28301 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LoxP28301 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LoxP28301 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LoxP28301 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LoxP28301 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LoxP28301 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LoxP28301 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LoxP28301 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LoxP28301 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LoxP28301 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LoxP28301 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LoxP28301 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LoxP28301 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LoxP28301 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LoxP28301 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LoxP28301 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LoxP28301 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LoxP28301 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LoxP28301 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LoxP28301 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LoxP28301 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LoxP28301 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1142.1 ms