Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav1P27870 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav1P27870 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vav1P27870 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vav1P27870 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vav1P27870 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vav1P27870 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vav1P27870 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vav1P27870 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vav1P27870 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vav1P27870 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vav1P27870 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vav1P27870 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms