Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
CenpbP27790 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
CenpbP27790 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,8■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
CenpbP27790 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,36
CenpbP27790 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,75■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC29,73■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
CenpbP27790 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,71■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
CenpbP27790 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,34
CenpbP27790 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
CenpbP27790 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
CenpbP27790 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
CenpbP27790 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
CenpbP27790 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,6■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,59■■■□□ 2,33
CenpbP27790 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
CenpbP27790 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29,58■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
CenpbP27790 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
CenpbP27790 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
CenpbP27790 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
CenpbP27790 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,5 ms