Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lef1P27782 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lef1P27782 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lef1P27782 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lef1P27782 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lef1P27782 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lef1P27782 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lef1P27782 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lef1P27782 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lef1P27782 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms