Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afxP27661 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afxP27661 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afxP27661 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afxP27661 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2afxP27661 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afxP27661 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afxP27661 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2afxP27661 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms